コンテナ型植物工場の栽培品目は非常に豊富で、以下は商業化に最も適した5つの方向です：
1. 短周期葉菜（商業化が最も成熟）
- レタス、ほうれん草、小白菜、ルッコラ
- 成長周期は60日から30日に短縮可能
- 40フィート標準コンテナで1回あたり約5800株を栽培可能
2. 芽菜／ミニ野菜
- エンドウ豆苗、大根苗、小麦草
- 約7日で1回収穫、技術門戸が低く、農薬残留なし
3. 高価値ハーブ／薬用植物
- バジル、ミント、シソ、キンセンレン
- 安定した「道地」品質を提供可能で、高級レストランや製薬企業向けカスタマイズに適する
4. 畜産用飼料
- 水耕大麦草
- 単一コンテナで1回あたり約8トンを生産可能、精飼料の20％を代替
5. 苗／育種
- イチゴ苗、花卉苗、研究用育種
- 無菌環境で育種を加速し、生存率が高い
さらに、キノコ類の栽培（ニレ黄まいたけ、ヤマブシタケ、モリーユ、マツタケなど）もコンテナ型植物工場の重要な応用分野であり、多くの成功事例があります。
